Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nup37Q9CWU9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup37Q9CWU9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms