Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sppl3Q9CUS9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sppl3Q9CUS9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms