Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms