Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud1Q9CUB6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud1Q9CUB6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms