Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms