Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms