Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029F12RikQ9CRB4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms