Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nkiras2Q9CR56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkiras2Q9CR56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms