Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ykt6Q9CQW1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.5 ms