Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd5Q9CQP3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd5Q9CQP3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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