Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nicn1Q9CQM0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms