Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudt21Q9CQF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudt21Q9CQF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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