Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTRAFQ9CQE8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms