Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700129C05RikQ9CQ77 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700129C05RikQ9CQ77 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms