Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp2Q9CQ73 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp2Q9CQ73 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp2Q9CQ73 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms