Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpa3Q9CQ71 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpa3Q9CQ71 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms