Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc18Q9CQ07 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc18Q9CQ07 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms