Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt88Q9CPR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms