Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe41Q99PV5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms