Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vgll1Q99NC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms