Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tdrd1Q99MV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tdrd1Q99MV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms