Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms