Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp16Q99LG0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms