Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds2Q99L43 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cds2Q99L43 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms