Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99KU6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99KU6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99KU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99KU6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99KU6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99KU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms