Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DhddsQ99KU1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms