Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me2Q99KE1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me2Q99KE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me2Q99KE1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms