Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pls3Q99K51 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms