Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GatbQ99JT1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms