Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin3Q99JB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms