Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms