Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apobec3Q99J72 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec3Q99J72 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec3Q99J72 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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