Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc8b1Q925Q3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc8b1Q925Q3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms