Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf7Q922B6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf7Q922B6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf7Q922B6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf7Q922B6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf7Q922B6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf7Q922B6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Traf7Q922B6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Traf7Q922B6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Traf7Q922B6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf7Q922B6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms