Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1bQ920F6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms