Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca5Q91ZW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca5Q91ZW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms