Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Rpe65Q91ZQ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Rpe65Q91ZQ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Rpe65Q91ZQ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rpe65Q91ZQ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rpe65Q91ZQ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpe65Q91ZQ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rpe65Q91ZQ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rpe65Q91ZQ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rpe65Q91ZQ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rpe65Q91ZQ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpe65Q91ZQ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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