Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtmr4Q91XS1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr4Q91XS1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms