Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms