Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pth2Q91W27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms