Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul7Q8VE73 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cul7Q8VE73 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms