Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms