Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnaaf4Q8R368 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf4Q8R368 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms