Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg10Q8R1P4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg10Q8R1P4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms