Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CipcQ8R0W1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CipcQ8R0W1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CipcQ8R0W1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CipcQ8R0W1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms