Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms