Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casc3Q8K3W3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casc3Q8K3W3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casc3Q8K3W3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casc3Q8K3W3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casc3Q8K3W3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casc3Q8K3W3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casc3Q8K3W3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms