Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rdh16f2Q8K3M1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rdh16f2Q8K3M1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh16f2Q8K3M1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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