Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MyripQ8K3I4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MyripQ8K3I4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms