Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk5rap2Q8K389 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms